Выпускники НГУ приняли участие в масштабном филогенетическом исследовании
Выпускники НГУ приняли участие в масштабном филогенетическом исследовании
В декабрьском номере журнала Science, основной темой которого стали орнитологические исследования, вышел цикл статей, освещающий основные результаты работы международного научного коллектива. В его состав вошли более 200 ученых из 20 стран и 80 научных лабораторий. Среди соавторов статей – выпускники НГУ Денис Ларкин (University of London) и Полина Перельман (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН).
Группа ученых поставила задачу разрешить филогенетические вопросы (прояснить эволюционные взаимоотношения среди разных видов жизни наЗемле, как современных, так и вымерших) с помощью сравнения ДНК-последовательностей всего генома.
Систематика птиц имеет множество нерешенных вопросов не только на уровне видов и подвидов, но и на более высоких уровнях отрядов ученые не могут прийти к консенсусу по поводу порядка ответвления на древе птиц.
Предпринимаемые ранее попытки систематики птиц с помощью традиционных методов сравнения по морфологическим признакам или по сравнению ограниченного набора ДНК последовательностей (менее 20 генов) смогли разрешить все вопросы. Полногеномные данные тоже пока не смогли дать однозначную картину эволюции птиц. Одна из причин – очень быстрое и «одновременное» по меркам эволюции появление множества новых видов, которое произошло после вымирания динозавров. Однако многие ответы все же удалось получить.
– Эта статья – новая веха в исследованиях недавно появившегося направления филогеномики – построения эволюционных древ на основе геномных данных, – рассказывает Полина Перельман. – На сегодняшний день отсеквенировано уже немало геномов животных, но только для птиц была специально отобрана группа геномов для секвенирования, чтобы потом провести всеобъемлющий анализ всего класса.
Ученые из Новосибирска участвовали в проекте на первых этапах.
– Отдел разнообразия и эволюции геномов ИМКБ СО РАН - участник проекта «Геном 10К», возглавляемого Стивеном О'Браейном, Дэвидом Хаслером и Оливером Райдером. Проект ставит амбициозную цель секвенирования 10 тысяч геномов животных. Мы осуществляли проверку принадлежности выделенной ДНК к определенному виду птиц, – отмечает Полина. – Сейчас наступает один из интереснейших этапов – расшифровки геномных данных. Огромный шаг уже сделан – геномы отсеквенированы, теперь можно приниматься за самые интересные вопросы – исследовать как работают гены для создания определенного признака (например, окраса перьев или формирования пения).
В ходе всего проекта по секвенированию и анализу геномов птиц было сделано множество новых открытий, поэтому была опубликована не одна статья, а цикл, в который вошло около тридцати статей. Новое древо птиц из статьи по филогеномике теперь войдет в учебники.
Официальный сайт Новосибирского госуниверситета
Комментарии